Shadowrun merupakan kombinasi antara permainan first person shooter dengan role playing game. Permainan ini menceritakan tentang dunia dimasa yang akan datang dimana keberadaan ilmu-ilmu magis telah kembali ke dunia dan memberikan perubahan besar pada dunia. Sebuah artifak dari jaman kuno dengan kekuatan aneh muncul seiring perubahan tersebut dan terjadi perselisihan antara dua belah pihak dalam memperebutkan artifak tersebut yang hingga 20 tahun kemudian masih berlanjut.